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lncRNA对通路的调控网络 lncRNA Target Pathway Network 根据差异lncRNA和被调控靶基因的显著性通路,利用lncRNA和靶基因通路的属性,构建lncRNA Target Pathway Network。该网络反映目标lncRNA对Pathway的作...
构建circRNA调控网络CircRNA-mRNA-miRNA-Network 分别对miRNA与mRNA、miRNA与circRNA进行靶向预测,并根据表达趋势取负相关。根据结果找出具有mRNA-miRNA-circRNA关系的mRNA/circRNA对。计算差异基因和差异...
GOEA 分析 (Network visualization of Gene Ontology enrichment analysis of basal DE genes) Jaccard index, 又称Jaccard相似系数(Jaccard similarity coefficient)用于比较功能之间的相似性与差异性。Jaccard系数值越大...
构建MicroRNA-MicroRNA共调节网络(miRNA-miRNA-correlation) 既往研究已证明不同microRNA通过相互之间合作,共同调控靶基因。利用数据库及算法预测miRNA靶基因,当两个miRNA共调控至少一个靶基因...
基因富集分析 (Gene Set Enrichment Analysis,GSEA) 通过基因在两类样本中的差异表达程度排序,检验预先设定的基因集是否在这个排序表的顶端或者底端富集,检测差异基因的表达在已定义的...
基因富集网络分析GSEA Network 利用GSEA分析识别出某条件下相关的生物学过程和信号传导通路,将其中显著性的基因集(FDR 0.001, P 0.05),基于基因集中基因所占比例以及基因集间的共享基因...