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Coexpression Network是分析lncRNA与mRNA相互作用关系的创新工具。Coexpression Network根据lncRNA及mRNA的实测值,通过共表达计算方法构建网络。通过lncRNA周边与其共表达的mRNA来预测未知lncRNA的功能...
分别对miRNA与mRNA、miRNA与lncRNA进行靶向预测,并根据表达趋势取负相关。根据结果找出具有mRNA-miRNA-lncRNA关系的mRNA/lncRNA对。计算差异基因和差异lncRNA间的共表达关系,挑选出互为正相关...
对于按照处理时间、浓度、疾病恶化程度顺序设计的序列实验,为了筛选出随样本顺序变化影响最显著、最主流的基因群,需要对样本的差异基因进行基因表达趋势分析。应用模糊聚类...
应用miRanda 、TargetScan、Pictar等数据库的软件预测microRNA靶基因。...
通过自由能计算,推断LncRNA结合miRNA的能力,得到LncRNA-mRNA靶向关系。( LncRNA-miRNA靶向预测 )...
通过自由能计算,推断circRNA结合miRNA的能力,得到circRNA-mRNA靶向关系。...