GOEA分析（Network visualization of Gene Ontology enrichment analysis of basal DE genes）
Jaccard index, 又称Jaccard相似系数（Jaccard similarity coefficient）用于比较功能之间的相似性与差异性。Jaccard系数值越大，功能相似度越高。红色代表上调基因显著性调控的功能，蓝色代表下调基因显著性调控的功能，先对功能进行层级聚类，筛选Jaccard大于0.25的功能集合，最终以网络方式呈现差异基因富集的功能集合。
文章案例： 研究人员利用转录组学、表观遗传学和免疫学的方法发现围产期S100A8 和 S100A9过量表达导致MyD88依赖性促炎基因程序发生改变。图为 LPS刺激后与对照差异基因富集功能网络。
参考文献：S100-alarmin-induced innate immune programming protects newborn infants from sepsis，nature immunology 2017.
Jaccard index, 又称Jaccard相似系数（Jaccard similarity coefficient）用于比较功能之间的相似性与差异性。Jaccard系数值越大，功能相似度越高。红色代表上调基因显著性调控的功能，蓝色代表下调基因显著性调控的功能，先对功能进行层级聚类，筛选Jaccard大于0.25的功能集合，最终以网络方式呈现差异基因富集的功能集合。
文章案例： 研究人员利用转录组学、表观遗传学和免疫学的方法发现围产期S100A8 和 S100A9过量表达导致MyD88依赖性促炎基因程序发生改变。图为 LPS刺激后与对照差异基因富集功能网络。
参考文献：S100-alarmin-induced innate immune programming protects newborn infants from sepsis，nature immunology 2017.
