全基因组甲基化测序

Part 1 全基因组甲基化检测

来源:小博发布时间:2018-11-19

850K甲基化芯片检测服务


201603040953455956DNA甲基化对基因表达调控起着重要作用。借助Methylation EPIC BeadChip(下文中以850K芯片代称),研究人员可以基于单核苷酸分辨率定量检测基因组中的850,000多个甲基化位点。包括FFPE在内的多重样本可以并行分析,以便在每样本最低成本的情况下实现高通量功能,广泛应用于干细胞研究、肿瘤和其他复杂疾病研究,是目前最适合表观基因组全关联分析研究的全基因组DNA甲基化芯片。








850K甲基化芯片优势

●       权威性高:唯一权威的甲基化芯片,针对人源样本研究性价比最高;
●       覆盖度全:全基因组覆盖,单碱基分辨率,可直接精确检测85万个甲基化位点;
●       通量度高:可一次性检测8(16/32/96)个以上样品;
●       操作性易:无需“甲基化DNA免疫共沉淀”,亚硫酸氢盐处理基因组DNA即可进行芯片实验;
●       样本量低:无须PCR扩增;模板量可低至250ng
●       重复性高:技术重复的重现性>98%;
●       性价比高:成本约为WGBS的三分之一;
●       兼容性广:多种样本可用,兼容FFPE样本。

850K样本要求: OD 260/280值应在1.7~2.0 之间;浓度不低于50ng/μl;每个样品总量不少于2μg;-80度保存,干冰运输。




全基因组甲基化测序服务(WGBS)
WGBS(Whole-genome bisulfite sequencing)是用Bisulfite处理,将基因组中未发生甲基化的C碱基转换成U,进行PCR扩增后变成T,与原本具有甲基化修饰的C碱基区分开来,再结合高通量测序技术,与参考序列比对,即可判断CpG/CHG/CHH位点是否发生甲基化,特别适用于绘制单碱基分辨率的全基因组DNA甲基化图谱。





WGBS技术优势:
●       覆盖度全面:全基因组覆盖,单碱基分辨率,可检测所有甲基化位点,包括非编码区域;
●       平台通量高:10X或NovaSeq平台,轻松完成多个样本的检测;
●       市场认可高:应用广泛,是DNA 甲基化研究的金标准;
●       数据分析全:从各个层面综合解析WGBS数据。

WGBS样本要求:OD 260/280值应在1.8~2.0 之间; RNA 应去除干净;最低浓度不低于50ng/µl;每个样品总量不少于15µg;样本低温运输。