RNA-深入分析

RNA-深入分析

  • CeRNA Network

    CeRNA Network

    分别对miRNA与mRNA、miRNA与lncRNA进行靶向预测,并根据表达趋势取负相关。根据结果找出具有mRNA-miRNA-lncRNA关系的mRNA/lncRNA对。计算差异基因和差异lncRNA间的共表达关系,挑选出互为正相关...

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  • GSEA Network

    GSEA Network

    基因富集网络分析GSEA Network 利用GSEA分析识别出某条件下相关的生物学过程和信号传导通路,将其中显著性的基因集(FDR 0.001, P 0.05),基于基因集中基因所占比例以及基因集间的共享基因...

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  • miRNA-miRNA-correlation Network

    miRNA-miRNA-correlation Network

    构建MicroRNA-MicroRNA共调节网络(miRNA-miRNA-correlation) 既往研究已证明不同microRNA通过相互之间合作,共同调控靶基因。利用数据库及算法预测miRNA靶基因,当两个miRNA共调控至少一个靶基因...

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  • GOEA Analysis

    GOEA Analysis

    GOEA 分析 (Network visualization of Gene Ontology enrichment analysis of basal DE genes) Jaccard index, 又称Jaccard相似系数(Jaccard similarity coefficient)用于比较功能之间的相似性与差异性。Jaccard系数值越大...

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  • Gene Set Enrichment Analysis(GSEA)

    Gene Set Enrichment Analysis(GSEA)

    基因富集分析 (Gene Set Enrichment Analysis,GSEA) 通过基因在两类样本中的差异表达程度排序,检验预先设定的基因集是否在这个排序表的顶端或者底端富集,检测差异基因的表达在已定义的...

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  • CircRNA-mRNA-miRNA-Network

    CircRNA-mRNA-miRNA-Network

    构建circRNA调控网络CircRNA-mRNA-miRNA-Network 分别对miRNA与mRNA、miRNA与circRNA进行靶向预测,并根据表达趋势取负相关。根据结果找出具有mRNA-miRNA-circRNA关系的mRNA/circRNA对。计算差异基因和差异...

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