转录组学（transcriptomics），是一门在整体水平上研究细胞中基因转录情况及转录调控规律的学科，从RNA水平研究基因表达情况，是研究细胞表型和功能的一个重要手段。与基因组不同，转录组的定义中包含了时间和空间的限定。同一细胞在不同的生长时期及生长环境下，其基因表达情况是不完全相同的。利用第二代高通量测序技术进行cDNA测序，全面快速地获取某一物种特定器官或组织在某一状态下的几乎所有转录本。转录水平的测序不仅能够提供更精确的数字化信号，更高的检测通量以及更广泛的检测范围，并且可以借助生物信息手段快速筛选出miRNA作用的靶基因，为研究miRNA与其对应的靶基因的相互关系提供准确、高效的筛选手段。
