RNA领域研究

Affymetrix Clariom S芯片

来源:小博发布时间:2017-06-28

Clariom™ S  —— 业界领先的人、大鼠和小鼠基因水平芯片解决方案

Clariom™ S为科研工作者提供最快、最便捷以及最灵活的方式去检测转录组内的基因水平变化(仅限于人类,小鼠和大鼠)。特别设计针对覆盖所有注释明确的基因,兼容不同类型样品包含临床来源样品,多种格式包含单张卡式芯片及高通量板式芯片满足不同样品通量研究需要。Clariom™ S是用于基因生物标志物筛选的快速经济工具,也是研究注释明确基因的最好工具—简单、高速、低成本。

Clariom™ S芯片优势
准确定量: > 20,000个注解基因的基因表达水平检测。
灵活性高:根据需选择适合芯片格式,单张卡式芯片或者高通量板式芯片。
经济高效:价格经济,每天可处理1到192个样本。
分析快捷:专业的分析工具,几分钟内就可完成。
注释明确:针对已知基因都有明确注释,助于提高数据利用率


Clariom™ S探针覆盖情况

Content summary Human Mouse Rat
Gene >20,800 > 22,100 >22,900
Transcripts >337,100 >150,300 >129,800
Total probes >211,300 >221,900 >231,800



Clariom™ S注释数据库来源
 
Content summary Human Mouse Rat
Esemble >20,000 >21,700 >20,500
VEGA >19,900 >14,700 -
NONCODE >12,200 >9,200 -
lncRNAWiki >12,200 - -
UCSC Genes >19,800 >21,000 -
AceView >10,800 - >18,000
miTranscriptome >10 - -
Refseq >19,500 >20,800 >16,500
MGC >17,100 >17,300 >6,400
MGI - >21,300 -
RGD - - >21,700
Consensus CDS >18,500 - -
RNA Central >1,100 - -
circBase >11,500 - -
Human Body Map >400 - -
lincRNAdb >10 >10 >2
Publication-specific gene sets >3000 - >8,020
Non-overlapping orthologous mouse gene and transcript models - - >20


Clariom™ S样品要求:
※ 样品量:最低100 pg总RNA就可进行表达谱检测。(低至10个细胞)
※ 样品质量:260/280在1.8-2.1之间,凝胶电泳28S跟18S要清晰可见,并且弥撒不能严重。
※ 样品类型:各种样品类型的RNA,包括血液,细胞和新鲜/新鲜冷冻或FFPE组织。  
备注:针对特殊微量样品,可结合Clariom™ S芯片Clariom™ S Pico 试剂盒进行表达谱检测