RNA领域研究

sRNA测序

来源:小博发布时间:2017-05-15

        小RNA是一类长度在20-30nt的RNA分子,主要包括miRNA、siRNA和piRNA等,参与调控基因表达、生长发育、非生物胁迫和病原菌的侵害等过程。小RNA测序是基于Illumina HiSeq2500测序平台对目标物种小RNA进行大规模测序分析,能够快速全面地鉴定该物种在特定状态下的小RNA和发现新的小RNA,并预测其靶基因。小RNA测序为研究小RNA的种类、结构和功能及此物种的基因调控机制提供了有力工具。

主要研究方向
        1. 小RNA的系统识别和鉴定;
        2. 发现新的miRNA;
        3. miRNA差异表达分析;
        4. 靶基因预测;
        5. 靶基因功能注释。


测序方案
         1. 测序平台:Illumina Hiseq 2500;
         2. 测序类型:SE50;
         3. 测序数据量:10M Reads。



sRNA测序实验流程


sRNA测序分析流程

 


sRNA测序样品要求
样品纯度:OD260/280为1.8-2.2,完整无降解
样品浓度:
Total RNA:≥2 μg , 浓度≥100ng/μl
适用范围:真核生物(有、无参考基因组皆可)

sRNA测序项目实验流程:



sRNA测序项目分析流程:
 
sRNA测序样品要求
● 样品纯度:OD260/280为1.8-2.2,完整无降解
 样品浓度:
Total RNA:≥2 μg , 浓度≥100ng/μl
● 适用范围:真核生物(有、无参考基因组皆可)