大家好，今天和大家分享一篇耳鼻咽喉科方面的文章：

    下咽喉癌（HPC）是一种侵袭性恶性肿瘤，从组织学上讲，下咽喉癌属于鳞状细胞癌，由于其经常诊断的时候就已经是晚期，因此生存率较低，总体预后情况不容乐观，疾病治疗挑战很大。

    由于手术会对咽喉的正常生理功能造成影响，多西他赛，顺铂和 5- 氟尿嘧啶（TPF）的化疗方案是另一种有效的治疗方案。

    但是，问题来了，不同的基因表达情况，导致了不同病人的化疗敏感性不同，给治疗带来很大的不确定性，这篇文章，就探讨不同化疗敏感性患者基因表达上的差异情况。文章发表于 Chin J Cancer Res 期刊，题目：Microarray gene expression analysis of chemosensitivity for docetaxel, cisplatin and 5-fluorouracil (TPF) combined chemotherapeutic regimen in hypopharyngeal squamous cell carcinoma .

文章作者：首都医科大学附属北京同仁医院，房居高老师课题组

文章亮点：珍贵的病人样本、逻辑清晰的生信分析、美观的图片展示

文章思路：

    1、招募了 21 例病人，并根据敏感性进行分组，12 例化疗敏感组，9 例化疗不敏感组；

    2、进行 Affymetrix 基因表达谱芯片检测；

    3、对表达谱芯片结果进行深入的生物信息分析
 

①聚类分析

②功能和信号通路分析

以上两个分析较为基础，接下来是一些比较深入的网络。

③信号通路-信号通路之间的转导网络

    蓝色代表下调通路、红色代表上调通路，箭头代表通路之间的信号传递顺序；通过这个分析工具，作者找到了「信号流」中的核心通路，即 MAPK 通路。

④基因-基因之间的信号网络

    蓝色代表下调基因、红色代表上调基因，箭头代表基因之间的相互作用。基因的相互作用的关系越多，其权重值越大。如下图，中央的基因调控权重值更大。

通过生物信息学分析挑选的重要信号通路「MAPK 信号通路、钙离子通路、Jak-STAT 信号通路、Wnt 信号通路」以及重点基因进行验证，结果与高通量检测结果相符。尤其是 MAPK 通路，在生信分析中，处于非常重要的枢纽位置。

文章总结：通过对耐药-非耐药病人的 Affymetrix 基因芯片高通量检测和深入的生物信息分析，发现 MAPK 通路在下咽喉癌的 TPF 化疗敏感性中，起到生物标志物作用，可尝试将其检测与化疗疗法相结合。

PS: 文章中涉及的基因芯片检测和数据分析由本公司完成

原文：Meng Lian,et al. Microarray gene expression analysis of chemosensitivity for docetaxel, cisplatin and 5-fluorouracil (TPF) combined chemotherapeutic regimen in hypopharyngeal squamous cell carcinoma. PMID: 28729771.

北京中康博生物科技有限公司（beijing Cnkingbio Biotechnology Co.LTD）是北方乃至全国最大的 Affymetrix 检测中心之一，公司以数据分析为特色，整合 Affymetrix 基因芯片、Illumina 二代测序、个性化生物信息分析三项核心服务。立足生命科学，为临床与基础研究领域的科学工作者提供分子生物学高端技术服务。